甫卸下行政院副院長職務的蔡英文，藍綠陣營都視她為可能的副總統候選人，她對兩岸的看法，被視為官方政策指標。6月11日，蔡英文應邀出席政大東亞所舉辦的「兩岸和平研究學術研討會」，這也是她2004年離開陸委會後，第一次針對兩岸事務發言。蔡英文強調，2008年將是兩岸關係重新整理的關鍵年度，台灣正面臨嚴峻的內外挑戰，內是政經結構調整的壓力已迫在眉睫，外是全球化的規模愈來愈大、速度愈來愈快，過去所奉行的規則已不敷使用。蔡英文建議中國政府，不要負面解讀台灣的民主發展，而且目前台、中都是WTO會員，在此組織中仍屬相對弱勢，彼此的合作應高於競爭，她相信未來1、20年，兩岸議題將更受國際注目，中國應更注重自由、民主、基本人權等普世價值，用和平手段解決紛爭，才能在2020年達成小康社會。
