本土新冠疫情持續延燒，如同台北市長柯文哲先前所說，終究疫苗才是唯一解套方法。台北市長柯文哲今（6/5）下午宣布，為了讓接種效率更快速，未來台北市民施打新冠肺炎疫苗全部免費；指揮中心晚上8時30分發布新聞稿表示，政府已於特別預算編列40億元，將在6月7日起，免費提供全民接種公費COVID-19疫苗服務，不需掛號費、藥事服務等費用，現行開放第一、二、三類人接種，未來會逐步往下開放。
指揮中心表示，為推動新冠疫苗大規模接種作業，特別條例修法於5月31日經立院三讀通過後，相關預算也於6月3日行政院會通過，6月7日起指揮中心已編列經費約40億元獎勵疫苗合約醫療院所作業，請合約醫療院所免費提供民眾COVID-19疫苗接種服務。
特別條例修法於5/31經立院三讀通過後，相關預算6/3在行政院會通過，用於請合約醫療院所免費提供民眾接種服務，另外編列費用補助22縣市政府及辦理社區和大型接種站的所需經費，可望加速全民接種速度，儘早達成群體免疫效果。
指揮中心發言人莊人祥表示，公費疫苗雖然免收診察費、注射費與疫苗費，但仍須依院所等級付掛號費，而公費疫苗費用的掛號費、藥事服務費等需付50至229元，但為鼓勵民眾接種，同時感謝醫療院所配合，下周一起全民接種疫苗都是免費，符合接種資格者仍須持健保卡報到驗證身份，但無須支付費用。
指揮中心強調，防疫相關政策皆秉持中央與地方「標準一致、做法一致、腳步一致」防疫原則，推動各項措施，也請相關單位及民眾主動積極配合，與政府共同努力，嚴守社區防線。
指揮中心補充說明，目前開放公費接種對象以公費接種對象優先如下：
一、雙北地區：第一類至第三類未曾接種第一劑疫苗之醫事、防疫人員及高接觸風險者優先接種。
二、雙北以外之縣市：未曾接種疫苗之第一類醫事人員為接種對象，並視疫苗接種進度，逐步開放至第二、三類及機構對象。目前未開放公費對象將於後續陸續開放公費接種。
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